屏東分署位於台灣本島南部，範圍介於東經120度24分至120度54分、北緯21度51分至23度22分之間；南北長165公里、東西寬58公里。其中國有林事業區東以中央山脈陵脊為界與台東分署管轄之延平、台東、大武及關山事業區毗鄰，北接嘉義分署管轄之玉山事業區，西鄰該處大埔、玉井事業區及西南平原、臺灣海峽，南面鄰巴士海峽，地跨高雄、屏東、嘉義、台東及台南等縣市，包括旗山、荖濃溪、屏東、潮州、恆春等五個事業區389個林班，加上高雄、屏東、澎湖等縣市境內之區外保安林地及接管自國有財產署經管之國有林地等，轄區總面積約為228,125公頃。